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科學家系統重建小鼠整個胚胎發育的細胞軌跡

哺乳動物胚胎發育的特點是細胞快速增殖和多樣化。在幾周內,一個單細胞就能分裂成數以百萬計的細胞,并生成各種各樣的功能分子。盡管哺乳動物體內發育的主要構成細胞軌跡已有大量研究,但對該過程進行全面描述仍然難以實現。美國華盛頓大學研究團隊提出了系統重建小鼠整個胚胎發育的細胞軌跡。該研究結果于近日發表在《Nature Genetics》上,題為:Systematic reconstruction of cellular trajectories across mouse embryogenesis。

研究人員整合了幾個單細胞RNA測序數據集,這些數據集覆蓋了小鼠的胃腸發育和器官形成過程,并補充了來自胚胎大約第8.5天的約15萬個細胞核的分析數據。總的來說,研究人員定義了從胚胎第3.5天到第13.5天連續19個階段的細胞狀態,并將它們與可能的祖先和后代建立聯系。該過程通過自動化程序構建。盡管如此,由此產生的有向無環圖(trajectories of mammalian embryogenesis,哺乳動物胚胎發育的軌跡)與現在對哺乳動物發育的理解認識一致。

綜上所述,研究人員利用TOME系統地篩選出一些轉錄因子作為每種細胞發育的候選調控因子,為胚胎發育的研究提供了新思路。

論文鏈接:

https://www.nature.com/articles/s41588-022-01018-x

注:此研究成果摘自《Nature Genetics》雜志,文章內容不代表本網站觀點和立場,僅供參考。

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